Während des langjährigen Bestehens der KWA Klinik Stift Rottal sind vielfältige regionale und überregionale Mitgliedschaften und Kooperationen entstanden.

• Arbeitsgemeinschaft für Geriatrie in Bayern (AFGiB)
• Deutsche Multiple Sklerose Gesellschaft
• Verband der Privatkrankenanstalten in Bayern
• Bayerische Krankenhausgesellschaft
• Bayern innovativ
• Bayerischer Paritätischer Wohlfahrtsverband
• Teilnahme am GiB-DAT-Projekt (Benchmarking bayerischer geriatrischer Rehabilitationskliniken)
• Bayerische und Deutsche Krankenhausgesellschaft
• Verband der Privatkrankenanstalten
• Bayern Innovativ
• Arbeitskreis Rehabilitation von Schlaganfallpatienten und Schädel-Hirn-Verletzten
• Arbeitsgemeinschaft Neurologische Intensivmedizin
• Deutsche Multiple Sklerose Gesellschaft (DMSG)
• Deutscher Paritätischer Wohlfahrtsverband
• Bayerischer Heil- und Bäderverband
• Matrix-Center
• Seniorenbeirat der Bayerischen Staatsregierung

• Regionalbeauftragter der Deutschen Schlaganfallhilfe (Gütersloh)
• Zusammenarbeit mit dem Institut für Kommunikation und Gehirnforschung (Stuttgart) auf dem Gebiet der neuroaktiven Musiktherapie
• Zusammenarbeit mit dem Privatinstitut für Reha-Anwendungen (Karlsfeld): EMG-initiierte Muskelstimulation
• Yoga-Universität (Bangalore, Indien)
• Zusammenarbeit mit der Firma Pohlig GmbH Orthopädie-Technik Traunstein
• Zusammenarbeit mit dem AVWF Zentrum in Blomberg (Audiovisuelle Wahrnehmungsförderung)
• Zusammenarbeit mit dem Matrix-Center München (Matrix-Rhythmus Therapie nach Dr. Randoll)
• Bernd-Blindow-Schule für Physiotherapie Leipzig
• VPT-A.K. Berufsfachschule für Physiotherapie Bad Birnbach
• Akademie für den physiotherapeutischen Dienst, Ried (Österreich)
• Private Berufsfachschule für Ergotherapie der ZB – Privatschule GmbH (Vilshofen)
• Haupt- und Realschule am Ort: Betriebspraktika für Schulabgänger
• Einsatzstellen für Freiwilliges Soziales Jahr (Regensburg)
• Einsatzstelle für Zivildienstleistende (Deggendorf)
• Teleradiologische Verbindung mit Radiologischer Praxis Passau, Krankenhäuser Vilshofen und Rotthalmünster und Neurochirurgie Uni-Klinikum Regensburg